Инфраню – Югоизточна Европа има следната организация на управление:
-
Председател – представлява и организира оперативната дейност на сдружението;
-
Заместник-председател – подпомага Председателя в основната му дейност;
-
Управителен съвет – превръща формулираните политики от Общото събрание в конкретни решения; извършва текуща дейност по сфери на компетентност в изпълнение на задачите на сдружението;
-
Общо събрание – формулира основните политики на сдружението, описани в Устава;